公元1399年，燕王朱棣开始南下“清君侧”，在他入主南京之前，他的重要谋士姚广孝（道衍和尚）曾向他提出了一个请求。姚广孝希望朱棣进了南京之后，务必不要把一个叫方孝孺的人杀掉，因为“杀孝孺，天下读书种子绝矣。”。

据《明史》等书记载，方孝孺出生于官宦之家，他的户口在浙江，他打小就属于那种别人家的孩子。如果按照正常剧情发展，他应该会通过科举考试进入仕途。但是，因为他爹被牵涉进了一起案件，所以他这个“罪犯”的后代，无法通过科举的政审，如果不出意外，方孝孺应该和唐朝的李白一样，无法进入仕途了。但是，方孝孺因为能力突出，被一个叫宋濂的浙江老乡给相中，并被其收入门下。

明朝的文人圈子里，宋濂说自己排第二，就连“神机军师”刘伯温也不敢说自己是第一。因为宋濂并不是一个人在战斗，他的背后还有一大群人，这群人就是江南的士族。朱元璋当年看重宋濂，就是想通过宋濂拉拢整个江南士林。

由此就能看出宋濂的真实身分，他其实是江南士林在朝中的代言人。

方孝孺入了宋濂门下之后，深受宋濂青睐。后来朱标英年早逝，朱元璋为了给孙子铺路，弄走了很多有威望的老人，宋濂也是其中之一。而宋濂隐退之后，方孝孺就被推了出来，可以说，在宋濂之后，方孝孺就成了江南士林的代言人。

而值得一提的是，姚广孝年曾和宋濂有过交往，他应该深知宋濂背后的能量，所以他才建议朱棣不要杀方孝孺，因为方孝孺代表的不是他个人，他代表的是江南士林。朱棣当时也同意了姚广孝的建议，但是最后他还是杀了方孝孺。

史书中，姚广孝虽然只说了那么一句话，朱棣就答应了。但实际上，姚广孝应该为朱棣分析了很深，那么朱棣既然已经知道方孝孺背后的力量，为什么不去拉拢，反而非杀他不行呢？

公元1402年，朱棣在李景隆的放水下，几乎兵不血刃地就拿下了南京，然后他要“帮助”的侄子建文帝突然自焚了，于是本来是想“清君侧”的朱棣，只好勉为其难的当皇帝了。

当皇帝这种事，不能你坐上龙椅就算完，你还要写诏书给大家通知一下。为了让这封诏书更有权威，所以这封诏书也必须有权威人士来写。军方那边，朱棣不用担心，自己能打到南京城，就已经展示出了实力。

但是士林这块，他却不能靠露肌肉搞定，必须要有一个江湖地位高的大咖给他月台，他当时选择的是“饶了一命”方孝孺。但朱棣没想到的是，方孝孺宁死不屈。朱棣一看方孝孺不合作，就只能杀了他，因为这个时候再留着方孝孺，就会有很大的隐患。

传闻当时朱棣诛杀了方孝孺的“十族”，其实这是一种误读，不过当时朱棣为了肃清方孝孺的影响，并不只是杀了方孝孺一个人，而是把和他有关的人也都用不同方式处理了，据《明史》等书记载，当时受到波及的人数足有1300多人。

这说明什么，这说明朱棣当时想要除掉的，不是方孝孺一人，而是以方孝孺为首的一股势力，这股势力，应该就是以方孝孺为代表的的江南士林在朝中的势力。